Nos Heroes Rise: Prison Break - Parte 2, seu personagem está em uma terra estranha, onde todos os heróis foram derrotados e presos. Os bandidos agora estão no comando. Estranhamente, quando você se encontra nesta terra, você percebe que não está em seu próprio corpo, mas está vivendo no corpo de um traidor. Esse traidor é odiado porque ele traiu os heróis que estão presos e é por isso que eles foram presos. Então, agora de alguma forma você precisa justificar sua existência e descobrir como tirar todos da prisão.